环境作为整个社会和人类的公共物品,对经济社会的可持续发展起着至关重要的作用。当代经济社会的高速发展所带来的环境问题越来越严重,因此需要政府通过行政手段对环境进行综合整治。而水环境作为环境整体的一部分,我国政府投入大量的资金对水资源污染情况进行治理。在大环境的背景下,政府审计部门的专项审计力度不断加强,在原有的基础上探索新的审计方法、丰富原有的审计内容。对水污染防治绩效审计加强整治,对其进行专项审计,保障专项资金的征收和使用合理合规有效,对推动水污染防治工作的有效开展发挥了积极作用。近些年水环境绩效审计项目大多数是依据资源环境价值理论,强调环境管理的经济性,强调环境资源的成本。本文在研究方法上,从受托环境责任理论、可持续发展理论和外部不经济性理论三大理论为出发点,在研究的内容上,对国内外政府绩效审计相关理论与实践工作经验进行整理和分析,评价我国目前水环境绩效审计的现状,并结合2011年第37号审计结果公告九个省市对城镇污水垃圾处理的案例,对审计案例的实际审计过程进行阐述分析和总结。除了对其产生的经济效益进行审计外,注重对环境效益和社会效益所采取的审计方法进行评价。采用理论联系实际的方法,对水污染防治的环境绩效审计展开研究。基于对九个省市城镇污水垃圾处理案例的分析,研究我国水污染防治在环境绩效审计中存在什么问题,这些问题存在的原因是什么,应对这些问题的对策有哪些;结合案例分析,提出了进一步搞好水污染防治绩效审计的建议。