鲫鱼是我国广泛养殖的重要食用和观赏鱼类,并且具有两性生殖的二倍体亚种和天然雌核发育的多倍体亚种,是研究鱼类生殖控制和基因组进化的独特材料。DMRT (doublesex and mab-3related transcription factor)家族是一个与性别决定相关的转录因子家族。为了研究家族成员之一的Dmrt3在我国重要养殖鱼类鲫鱼胚胎发育、性别分化中的功能以及在育种中的作用,我们利用简并PCR和快速扩增cDNA末端技术(RACE)克隆得到了鲫鱼Dmrt3基因的全长cDNA。采用半定量和嵌套式PCR的方法对Dmrt3基因在发育早期和不同组织中的表达进行了分析。采用染色体步移(Genome Walking)的方法获得了鲫鱼该基因启动子上游序列。实验结果显示：鲫鱼Dmrt3基因cDNA全长为2179bp,其中5’端非编码区408bp,3’端非编码区424bp,开放阅读框1347bp,编码448个氨基酸。蛋白结构预测显示DMRT3除了正常的DM结构域外,还有DMA结构域,在进化上与DMRT4和DMRT5的亲缘关系更近。巢式RT-PCR分析结果表明Dmrt3直到尾芽期才开始有微量表达,表达量在15体节期有明显增加但仍然处在一个较低的水平；成体组织中只在精巢中检测到表达。这种表达时空模式提示Dmrt3可能在早期器官发生和雄性性腺发育调控中起作用。实验中获得鲫鱼Dmrt3基因启动子上游1207bp序列,在其中存在一个CpG岛区域,采用亚硫酸氢盐测序的方法对Dmrt3启动子CpG岛的甲基化分析表明所检测的组织和配子中并不发生甲基化,说明这种雌雄特异性和组织特异性差异表达并不是通过对该基因启动子的差异甲基化修饰来调控的。此外,我们还发现了鲫鱼Dmrt3的一个由逆转录产物形成的假基因pDmrt3。这些结果为进一步研究鲫鱼Dmrt3在性别分化中的作用和评估其在鲫鱼性别控制育种中的价值,以及分析DMRT家族的进化关系提供了基础资料。