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阿尔茨海默病是一种神经退行性病变，其病理特征主要表现为大脑皮层及海马中神经维缠结及老年斑的形成。然而至今，其发病机制尚未完全清楚。随着近年来DNA甲基化研究的不断深入，发现与AD密切相关的基因如APP、PS1、PS2均发生了异常甲基化改变。那么是否存在着更多的异常甲基化基因参与到AD的发病机制中呢？本研究通过应用甲基化DNA免疫共沉淀结合芯片技术对APP/PS1双转基因阿尔茨海默病鼠模型进行研究，以期发现更多相关的异常甲基化致病基因。实验选取性别、年龄匹配的APPswe/PSΔE9双转基因阿尔茨海默病鼠模型与正常小鼠各3只，提取脑组织基因组DNA，MseI酶切使DNA片段化，并对酶切产物进行纯化，一部分酶切后的DNA样品预留为对照Input样品，另一部分进行免疫共沉淀为IP样品。然后5-甲基胞嘧啶抗体与DNA样品进行孵育，磁珠富集DNA-抗体复合物，蛋白酶K消化复合物，分离DNA片段并纯化。将IP和Input样品进行全基因组扩增并纯化，用Klenow酶进行标记(IP样品标记Cy5+Input样品标记Cy3)，将标记好的IP样品和Input样品进行芯片杂交，最后经芯片扫描仪获取图像，应用相关软件分析获得异常甲基化基因，并在线进行功能分析。芯片扫描获取图像后经NimbleScan及SignalMap软件分析得到log2-Ratio值，值越大代表该基因的甲基化程度越高，并统计检验P-value，P<0.05具有统计学意义，作为筛选标准。结果获得异常甲基化位点2347个，涉及基因485个，且它们分布在不同的染色体上，并结合KEGG数据库对异常甲基化基因在线功能分析对它们有了进一步了解。本研究通过应用甲基化芯片筛选出阿尔茨海默病鼠模型异常甲基化致病基因，这为后续验证实验奠定了坚实的基础，为人类AD发病机制的研究提供了线索，对将来AD致病基因甲基化谱的建立及其诊断、治疗均具有重要指导意义。