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肺结核已成为威胁人类健康的全球性疾病,在发展中国家仍然是一个重大的公共卫生负担。作为早期基因分型金标准的插入序列6110限制性片段长度多态性(IS6110‐RFLP)分型,其方法较为繁琐,结果不易分析,实验室间的结果很难进行比对。多位点数目可变串联重复序列基因分型(MLVA)技术简便快速,可操作性强,其速度远超其他分型方法,且适用于大规模菌株基因型鉴定。目的利用MLVA分型技术,探讨吉林省结核病院结核分枝杆菌的基因型,流行趋势以及分布情况,为吉林省结核病的防控工作提供理论依据。方法收集吉林省结核病院2011年-2012年肺结核患者痰液标本的结核分枝杆菌分离株,利用MLVA基因分型方法,对其进行基因分型的初步研究。本研究选用12个数目可变串联重复序列(VNTR)位点进行分型检测,采用Totalab软件对检测结果进行数据化分析,并利用BioNumerics(6.0)软件得出聚类分析结果。用SPSS(13.0)统计软件对462株结核分枝杆菌基因型不同因素的成簇性、186株优势菌株和与数据库比对所得北京家族基因型结果进行统计学分析。结果(1)462株结核分枝杆菌临床分离株的12个VNTR位点检测结果显示这些菌株均有明显的多态性,12个VNTR位点的Hunter-Gaston指数从0.296到0.756,其中分辨力较高的位点是MIRU26、MIRU31、MIRU10、MIRU40,中等分辨力的位点是MIRU16、MIRU4、MIRU39、MIRU27、MIRU23、MIRU24、MIRU2,分辨力较低的位点是MIRU20。(2)利用Ward法(树状图法)对462株临床分离株和1株标准菌株H37Rv,共463株菌株进行基因分型,分为4个基因群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ),406个基因型,其中Ⅰ群占45%(210/463),含有210株菌和191个基因型,标准株也在该群,为主要流行菌型。(3)最近邻法对462株临床分离株和1株标准菌株H37Rv进行MLVA分型,结果分为6个基因群(a、b、c、d、e、f),460个基因型,a群占80%(371/463),为主要流行基因型,标准株在b群。(4)将462株临床分离株及标准株与数据库比对,结果显示北京家族基因型占70%(324/463),非北京家族基因型占30%(139/463)。非北京家族基因型主要包括Bov、CAS、H3、H4、T1、T3、LAM等基因型。(5)462菌株成簇基因型与非成簇基因型在性别(χ2=0.289,P=0.591)、年龄(χ2=0.909,P=0.340)、初治复治(χ2=3.135,P=0.077)、是否合并疾病(χ2=0.404,P=0.525)、临床类型(P>0.05)之间差异均无统计学意义。(6)462菌株优势菌株与非优势菌株在性别(χ2=2.803,P=0.094)、年龄(χ2=0.201,P=0.654)、初治复治(χ2=0.001,P=1.000)、临床类型(χ2=0.228,P=0.633)之间差异均无统计学意义,感染优势菌株基因型的患者中合并疾病的人数所占比例高于感染非优势菌株基因型患者中合并疾病人数所占比例(χ2=6.292,P=0.012)。(7)462菌株北京家族基因型与非北京家族基因型在年龄(χ2=0.490,P=0.484)、初治复治(χ2=0.304,P=0.582)、是否合并疾病(χ2=0.41,P=0.522)、临床类型之间(P>0.05)差异均无统计学意义,感染北京家族基因型患者中女性所占比例高于感染非北京家族基因型患者中女性所占比例(χ2=5.909,P=0.015)。结论研究结果初步显示(1)MIRU26、MIRU31、MIRU10、MIRU40位点是分析吉林省462例肺结核患者结核分枝杆菌基因分型的首选位点。(2)462株结核分枝杆菌临床分离株存在着明显的遗传多态性。MLVA基因分型至少分为四个基因群,主要流行菌型为Ⅰ群和a群。(3)吉林省462例肺结核患者来自不同县市其主要基因型群存在差异,大部分地区与总体的流行趋势相符。(4)吉林省462例肺结核患者是否感染成簇基因型与性别、年龄、初诊和复诊、是否合并疾病、临床类型均无关。(5)吉林省462例肺结核患者是否感染优势菌株基因型与性别、年龄、初诊和复诊、临床类型均无关,仅与是否合并其他疾病有关,感染优势菌株基因型患者合并其他疾病患者的比例高于感染非优势菌株基因型患者中合并其他疾病患者的比例。(6)吉林省462例肺结核患者是否感染北京家族基因型与年龄、初诊和复诊、是否合并疾病、临床类型均无关,与性别有关,感染北京家族基因型患者中女性所占比例高于感染非北京家族基因型患者中女性所占比例。