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章太炎借助唯识思想中的三性问题来构建自己的哲学体系,三性即是遍计所执自性、依他起自性和圆成实自性。章太炎先借助三性讨论了世界上究竟有无本体的问题,阐明了世界上应有本体。这一本体并非是耶稣、上帝一样的人格神,而是一个无形无相的非人格神本体。接着,章太炎将这一本体与圆成实自性也就是真如结合一处,确立了他的真如本体论。在对真如的认知问题上,依他起自性的作用十分特殊和重要,同时依他起自性与阿赖耶识密不可分,所以章太炎以依他起自性和阿赖耶识的基本内涵形成了自己的认识论。最后,章太炎将唯识思想在继承的基础上加以发展深化运用,最终确立了自己的齐物观,并由此演绎出章太炎的政治观和历史观。