【摘 要】
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在使用引物27F/338R、338F/806R和515F/907R分别对细菌16S rRNA基因的V1-V2区、V3-V4区和V4-V5区进行扩增的基础上,采用Miseq高通量测序评价了扩增区域对鲊广椒细菌多样性分
【机 构】
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湖北文理学院食品科学技术学院鄂西北传统发酵食品研究所;
【基金项目】
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湖北文理学院教师科研能力培育基金(2017kypy051)
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在使用引物27F/338R、338F/806R和515F/907R分别对细菌16S rRNA基因的V1-V2区、V3-V4区和V4-V5区进行扩增的基础上,采用Miseq高通量测序评价了扩增区域对鲊广椒细菌多样性分析结果的影响。结果发现,扩增16S rRNA基因V4-V5区的非特异性序列所占比例显著偏低（P<0.05）,而扩增V1-V2区样品细菌的Chao 1指数显著偏高（P<0.05）。虽然扩增16S rRNA基因的V3-V4区会导致Cyanobacteria（蓝细菌门）和Pediococcus（小球菌）相对含量显著偏高（P<0.05）,但不同扩增区域扩增出的同一样品其微生物群落结构无显著差异（P>0.05）。在对鲊广椒细菌多样性进行解析时,建议选择引物515F/907R扩增16S rRNA基因的V4-V5区。
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