应用微阵列芯片初步分析胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱

来源 :肿瘤研究与临床 | 被引量 : 0次 | 上传用户:afanti76
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目的

应用微阵列芯片技术研究胃癌与癌旁正常组织miRNA差异表达谱,探讨miRNA与胃癌的发病关系。

方法

提取5例胃癌患者癌组织及其对应癌旁正常组织中的miRNA,分别与哺乳动物miRNA芯片V3.0杂交,扫描荧光信号,对癌组织、癌旁正常组织进行差异基因筛选和聚类分析。采用实时定量PCR Taqman荧光探针法验证差异表达的hsa-miR-30c、hsa-miR-196a、hsa-miR-193b。利用在线靶基因预测软件对hsa-miR-30c的靶基因预测。

结果

miRNA表达谱微阵列芯片筛选出显著差异表达的miRNA共16个,胃癌组织与癌旁正常组织比较,miRNA表达水平上调超过两倍且差异有统计学意义(P<0.05)的有5个,分别是HS_100、hsa-miR-27a、hsa-miR-214*、solexa-555-1991、hsa-miR-196,表达水平下调超过两倍且差异有统计学意义(P<0.05)的有11个,分别是hsa-miR-502-3p、hsa-miR-29c*、hsa-miR-64、hsa-miR-193b、hsa-miR-551b、hsa-miR-30c、hsa-miR-582-5p、hsa-miR-625*、hsa-miR-660、hsa-miR-363、hsa-miR-486-5p。荧光定量PCR验证hsa-miR-30c, hsa-miR-196a和hsa-miR-193b表达与miRNA芯片的结果相符合。

结论

胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱中的miRNA可能参与胃癌发生的调控,并将成为潜在的胃癌标志物。

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