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目的
评价首都医科大学附属北京天坛医院神经外科脑肿瘤生物样本库建库5年来样本RNA的质量。
方法收集首都医科大学附属北京天坛医院神经外科2011年1月至2015年12月的脑肿瘤样本,每年度随机选取20份,共100份,使用Trizol试剂提取组织总RNA,检测RNA的纯度、浓度、完整性及样本中GAPDH和ACTB内参基因表达水平。
结果2011年度至2015年度样本RNA合格率分别为25%、75%、85%、90%、100%。2011年度样本提取的总RNA大部分纯度和完整性不佳,RNA有部分降解,不能有效扩增内参基因GAPDH和ACTB,Ct值明显高于2012年度至2015年度样本的平均Ct值(P<0.01);2012年度至2015年度样本提取的总RNA的A260/A280比值均能达到1.8~2.1,A260/A230比值均能达到2.0以上,大部分样本RNA完整性较好,无降解,80份样本均能进行GAPDH和ACTB基因的有效扩增。
结论开展RNA水平的实验研究时,建议使用储存时间在4年以内的样本,且在组织样本使用前进行RNA的质量检测;并应每年定期监测样本质量,在样本出库前进行质量评价。