目的:分析菖蒲郁金汤辅助治疗重症病毒性脑炎患儿对神经功能、S100B蛋白、神经元特异性烯醇化酶(NSE)的影响。方法:选取重症病毒性脑炎患者66例,根据治疗方法不同分为对照组和观察组。对照组患者采用常规对症治疗,观察组患者加用菖蒲郁金汤进行辅助治疗,分析两组患者治疗后的临床效果。结果:观察组患者头晕目眩、神识昏蒙、四肢懈怠及身热不退等中医症候消失时间短于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。治疗前,两组患者S100B、NSE、β-EP水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。治疗3、10 d后,观察组患者S100B、NSE、β-EP水平低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。治疗前,两组患者MMSE评分比较,差异无统计学意义(P>0.05)。治疗后,观察组患者MMSE评分高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:菖蒲郁金汤辅助治疗重症病毒性脑炎可促进患者神经功能的恢复,降低S100B、NSE、β-EP水平,加快临床症状的消失。