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污染胁迫的最显著效应是消除敏感物种或个体，导致植物居群进化。突变是进化的原料，选择是进化的手段，隔离是进化的条件，控制抗性性状的基因因物种及污染物的种类不同而异，但也会出现植物同时具有对某两种或几种污染物的抗性，即所谓协同抗性；污染除使植物衰退外，还可能导致一些遗传信息丧失，使抗性种群内物种单一，降低其适合度，对其它环境胁迫因素的抵抗力下降，即所谓适应代价。