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针对目前的科技计划项目绩效评价系统存在的评价模型构建难、不具备数据挖掘和知识发现的功能等问题,提出一种基于数据挖掘技术的科技计划项目绩效评价系统的设计方法,给出了科技计划项目绩效评价系统的总体架构图、总体功能设计框图以及针对两图的设计思路,并对绩效评价所涉及到的ETL数据处理技术、绩效评价模型构建方法进行了研究。运用一种决策树技术和一种基于偏好系数的组合赋权法技术分别实现优化绩效评价模型的指标体系和指标权重的目标。该方法经过某一地市级的科技计划项目的绩效评价,结果显示该方法具有良好的使用效果。