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目的：分析研究早产儿抗菌药物的临床应用，促使其临床用药更具规范性，避免滥用抗菌药物。方法：随机选取2013年4月～2014年4月于本院出生的90例早产儿作为研究对象，随机分为对照组（n=45）以及观察组（n=45）。观察组早产儿严格依照抗菌药物指征使用药物，对照组早产儿依照临床常规方式使用抗菌药物；比较两组早产儿抗菌药物的使用率以及不良反应发生率。结果：观察组抗菌药物使用率以及不良反应的发生率均明显低于对照组，差异具有统计学意义（P＜0.05）；两组早产儿感染率差异无统计学意义（P＞0.05）；观察组早产儿人均抗菌药物费用以及人均预防应用抗菌药物的时间均明显优于对照组，差异具有统计学意义（P＜0.05）。结论：严格依据抗菌药物指征对早产儿应用抗菌药物可在一定程度上降低不良反应的发生率，减少抗菌药物费用、早产儿的抗菌药物使用时间，避免抗菌药物的不合理使用，具有临床应用价值。