两种植物病原黄单胞菌基因组中同义密码子使用的分析

来源 :植物病理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wyman_wmw

【摘要】

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根据已释放的基因组序列,对野油菜黄单胞菌野油菜致病变种(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)和地毯草黄单胞菌柑桔致病变种(X.axonopodis pv.citri,Xac)的密码子使

【作者】

：

钱韦

【机构】

：

中国科学院微生物研究所

【出处】

：

植物病理学报

【发表日期】

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2004年2期

【关键词】

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植物病原黄单胞菌基因组同义密码子使用分析 Xanthomonas campestris pv. campestris Xanthomonas axono

【基金项目】

：

国家自然科学基金

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根据已释放的基因组序列,对野油菜黄单胞菌野油菜致病变种(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)和地毯草黄单胞菌柑桔致病变种(X.axonopodis pv.citri,Xac)的密码子使用进行了分析.相对同义密码子使用值(relative synonymous codon usage,RSCU)的计算表明,它们具有高度相似的密码子使用模式.2个基因组密码子第3位的GC含量(GC3s)平均达0.806±0.077(Xcc)和0.791±0.07

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