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目的：比较甲硝唑与替硝唑治疗牙周炎的临床应用效果。方法：选取来我院进行治疗的牙周炎患者100例作为研究对象，随机分为观察组和对照组，所有的患者均给予常规龈上清洁治疗，并对其进行健康宣传教育。观察组在此基础上给予替硝唑治疗，对照组给予甲硝锉治疗。比较两组患者的治疗效果以及副作用发生率。结果：观察组患者的总有效率为94%，对照组患者的总有效率为76%，两组相比，差异有统计学意义（P＜0.05）；观察组患者的副作用发生率为6%，对照组患者的副作用发生率为22%，两组相比，差异有统计学意义（P＜0.05）。结论：替硝唑治疗牙周炎的临床效果优于甲硝唑，且副作用小，值得临床推广应用。