猪圆环病毒Ⅱ型广东分离株全基因组的克隆和序列分析

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分离了9株猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)广东地方分离株,并进行了全基因组序列测定;对这9株PCV2广东分离毒株的ORF1和ORF2基因的序列分析表明ORF2的变异程度要比ORF1的变异程度大;对PCV2衣壳蛋白的氨基酸序列同源性比较发现了PCV2毒株间存在1个氨基酸变异程度较大的区域和2个氨基酸变异程度较小的区域,其中前两个区域与两个主要的免疫反应区域相对应;将这9个毒株的全基因组序列与GenBank上收录的18个PCV2毒株的全基因组序列基因进化树分析表明,这9个PCV2广东分离株彼此之间及与国内PCV2分离株、欧洲株之间更接近,而与韩国、中国台湾、日本和美洲毒株之间则稍远,因而在选PCV2疫苗免疫时,建议尽量使用国内生产的疫苗或自制组织灭活疫苗进行免疫.
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