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如何使学生在短时间内、在有限的实验条件下掌握基因工程相关实验操作技能，更好地理解和应用基因工程理论，成为教师关注的问题。总结国内外基因工程实验课程开设的方式，分析各种方式的特点，在此基础上提出目标明确的大学生自主设计的实验开设方式，这可能是当前实验条件下较理想的方式。此方式应用于为北京中医药大学国家生命科学与技术人才培养基地三届学生开设的基因工程制药课程的实验课中，取得良好的效果。目标明确的大学生自主设计实验开设方式，不仅为相关院校基因工程课程实验开设提供借鉴，也为其他课程优化实验课教学提供有益的参考。