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在构建科技投入产出综合指标体系的基础上，提出了一个基于熵权和灰色关联分析的科技投入产出效率评价模型。该模型应用熵权法确定各评价指标的客观权重，克服了原始灰色关联中指标平权和专家赋值的不足。同时，熵权法与灰色关联分析法相结合充分利用了各指标的全部信息，且充分发挥了灰色关联适合具有一定灰度小样本事件的优势。最后通过实例验证了该模型的有效性和适用性。