【摘 要】
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为分析坡垒、青梅叶绿体基因组密码子偏好性使用模式,运用CodonW、R语言等软件对49条坡垒叶绿体基因组密码子和51条青梅叶绿体基因组密码子进行中性绘图、ENC-plot等系统分析
【机 构】
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海南五指山国家级自然保护区管理局,海南大学
【基金项目】
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海南省2019年森林生态效益补偿资金(302011)—微生物多样性与植物多样性项目.
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为分析坡垒、青梅叶绿体基因组密码子偏好性使用模式,运用CodonW、R语言等软件对49条坡垒叶绿体基因组密码子和51条青梅叶绿体基因组密码子进行中性绘图、ENC-plot等系统分析。结果表明,坡垒、青梅叶绿体基因组有效密码子数(ENC)均超过50,其密码子偏好性较弱。中性绘图分析发现,坡垒和青梅GC3与GC12相关不显著,回归斜率分别为0.21、0.18,说明密码子偏好性主要受到自然选择的影响。ENC-plot分析结果显示,两者均约有20个基因分布在ENC期望值曲线附近,这部分基因密码子偏性主要受突变影响
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