基于RNA–Seq五指山猪背最长肌基因表达差异分析

来源 :湖南农业大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：chimaomao

【摘要】

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为完善五指山猪基因结构和发掘新基因,采用转录组测序(RNA–Seq)技术对6、8月龄五指山猪背最长肌组织转录组进行分析。经过质量控制,分别得到65683578条(6月龄)和65464156条(

【作者】

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孙瑞萍魏立民王峰晁哲刘海隆郑心力刘圈炜黄丽丽

【机构】

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海南农业科学院畜牧兽医研究所,海南省热带动物繁育与疫病控制重点实验室

【出处】

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湖南农业大学学报：自然科学版

【发表日期】

：

2018年2期

【关键词】

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五指山猪基因表达基因结构可变剪接新转录本 Wuzhishan piggene structurealternative splicingnew tran

【基金项目】

：

海南省省属科研院所技术开发研究专项(KYYS–2015–02,琼科[2016]31号),国家自然科学基金项目(31560628,31760646),海南省农业科学院农业科技创新专项(CXZX201607)

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为完善五指山猪基因结构和发掘新基因,采用转录组测序(RNA–Seq)技术对6、8月龄五指山猪背最长肌组织转录组进行分析。经过质量控制,分别得到65683578条(6月龄)和65464156条(8月龄)有效序列;与猪基因组比对后发现,转录本序列分别为20102、25719个;通过与各数据库进行序列对比,功能基因分别有18206、18374个;朋6、8月龄五指山猪样品中预测的新转录本分别有687、737个,长度为180~14884bp,新转录本最少的仅含有1个外显子,而最长的包含40个外显子;新预测的可变剪接

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