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测定了江苏山羊品种的细胞色素b基因全序列1140bp，并引用10个山羊品种（群体）细胞色素b基因全序列进行比较，分析碱基组成和变异情况以及核苷酸序列差异。以绵羊为外群，分别采用邻近法、最大简约法和最大似然法构建分子系统树，得到的拓扑结构一致，初步提示了江苏山羊品种的系统进化关系：长江三角洲白山羊和黄淮山羊的亲缘关系较近，可能来自同一个母系；它们与日本山羊可能在较早的世代具有共同的祖先。本研究结果也支持将东亚、南亚和东南亚固有山羊群体划分为“东亚”和“南亚”两大亲缘系统的观点。