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从KEGG数据库中获得69种细菌的139组直系同源蛋白质序列,对它们的氨基酸组成及全基因组GC%含量与氨基酸组成关系进行各种分析。结果表明：核酸组成偏好对直系同源蛋白质的组成有极显著影响;不同功能类型的直系同源蛋白质氨基酸组成均受核酸GC%含量影响,氨基酸的组成受到选择压力与突变压力的双重影响。同时还指出,亲缘关系近的物种之间具有比全基因组GC%含量相近的物种之间更相似的直系同源蛋白质氨基酸组成。研究结果对于今后在各种研究中使用直系同源序列进行各种生物信息等相关分析,选择合适的物种材料具有重要的指导意义。