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长三角是我国经济最活跃、最具竞争力的区域，科技综合实力、区域创新能力住居全国前列。自2003年共同签署〈沪苏浙共同推进长三角区域创新体系建设协议书》以来，两省一市加快了科技合作的步伐，在联合开展科技攻关、实现科技资源共享、跨区域产学研合作、人才开发一体、加强知识产权协作等方面都取得了成效。但是，在科技合作的体制机制、科技合作的制度安排以及科技合作的投入等方面还存在不足。在国务院《关于进一步推进长江三角洲地区改革开放和经济社会发展的指导意见》的指示精神下，两省一市正在加快科技合作与创新的步伐。