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针对FPGA能较好满足高性能计算的异构多核、并行、低成本、低能耗要求，研究了高性能计算的重要的应用之一--- 多体问题。分析了多体问题应用广泛的FMM算法以及FMM算法的各个算枉，并在FPGA器件实现算粒，与多核CPU上实现这些算粒进行比较，FPGA都获得了不错的加速比。分析了FPGA应用高性能计算的一些优势和当前面I临的问题，对FPGA广泛应用高性能计算进行了初步探索。