7株野鸟源新城疫病毒F基因和HN基因遗传变异分析

来源 :中国病原生物学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:douche
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目的 了解野生鸟类新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)感染情况,分析NDV的基因型与遗传变异特点. 方法 采用HA试验和RT-PCR检测野生鸟类新城疫病毒感染情况,对新城疫病毒分离株的融合蛋白基因(F基因)和血凝素—神经氨酸酶基因(HN基因)进行遗传进化分析,了解F和HN基因相关分子特性. 结果 7株NDV的F基因序列分析表明显示其编码区核苷酸为1 662 bp,编码553个氨基酸.F基因碱性裂解位点序列为112G-K/R-Q-G-R-L117,均符合新城疫弱毒特征,与Ⅱ类NDV代表株核苷酸同源性为93.5%~99.9%.M46与M52为Ⅱ类Ⅱ亚型,其余5株为Ⅱ类Ⅰ亚型.HN基因序列分析显示,M46、M52编码区核苷酸为1 734 bp,编码577个氨基酸,其余5株编码区氨基酸为1 851 bp,编码616个氨基酸,与Ⅱ类代表毒株核苷酸同源性为92%~99.6%. 结论 分离的7株新城疫病毒在基因上均符合弱毒特点.其中有5株为Ⅱ类Ⅰ型,2株为Ⅱ类Ⅱ型.
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