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细胞ＤＮＡ受到某些环境理化因子损伤后，其中活性转录基因和ＤＮＡ转录链上的损伤被优先切除修复，这种ＤＮＡ选择性修复直接与基因转录过程偶联．在大肠杆菌中已分离到实现此功能的转录修复偶联因子（ＴＲＣＦ），是由ｍｄｆ基因编码的一种具有ＡＴＰａｓｅ活性的ＤＮＡ结合蛋白．在真核细胞中，发现某些ＤＮＡ修复蛋白也在ＤＮＡ转录中起作用，如人ＤＮＡ切除修复基因ＥＲＣＧ－３编码产物，是转录因子ＴＦⅡＨ中最大亚基ｐ８９，酵母切除修复基因ＲＡＤ３就是编码因子ｂ的最大亚基ｐ８５．