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西南林学院研究生教育始于1978年，1981年经国务院批准成为全国首批硕士学位授予单位，2002年经批准开始招收培养硕士专业学位研究生。2009年获批为国家立项建设新增博士学位授予单位。目前有一级学科硕士点3个，二级学科硕士点23个，农业推广（含5个领域）、风景园林硕士专业学位授权点2个。具有在职人员硕士学位授予权和外国留学生学位授予权。现有全日制在读研究生800余人，专业学位硕士研究生500余人。