C型凝集素结构域家族9成员A在肝细胞癌的预后价值及其对肿瘤免疫的影响

来源 :中华实验外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：

【摘要】

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目的通过生物信息学分析C型凝集素9家族A成员(CLEC9A)在肝癌中的作用。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库的泛癌转录组数据及临床数据，明确CLEC9A在泛癌中的差异表达，继而Kaplan-Meier分析CLEC9A的表达与泛癌的总生存期和疾病特异生存期的关系，并分析CLEC9A的表达与肝癌临床病理特征的相关性。通过基因集变异分析(GSVA)和免疫组织化学方法分析验证CLEC9A在肝癌免疫微环境的作用。结果基于配对与非配对的泛癌及正常样本的差异基因分析结果，肝癌组织中CLEC9A表达水平[0.18

【作者】

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陈德盛楼逸超朱齐孙红成

【机构】

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上海交通大学附属第一人民医院普外科　200080上海交通大学附属第一人民医院普外科　200080上海交通大学附属第一人民医院普外科　200080上海交通大学附属第一人民医院普外科　200080

【出处】

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中华实验外科杂志

【发表日期】

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2022年39期

【关键词】

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生物信息学癌症基因组图谱 C型凝集素9家族A成员肝癌 T细胞

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目的

通过生物信息学分析C型凝集素9家族A成员(CLEC9A)在肝癌中的作用。

方法

下载癌症基因组图谱 (TCGA)数据库的泛癌转录组数据及临床数据，明确CLEC9A在泛癌中的差异表达，继而Kaplan-Meier分析CLEC9A的表达与泛癌的总生存期和疾病特异生存期的关系，并分析CLEC9A的表达与肝癌临床病理特征的相关性。通过基因集变异分析(GSVA)和免疫组织化学方法分析验证CLEC9A在肝癌免疫微环境的作用。

结果

基于配对与非配对的泛癌及正常样本的差异基因分析结果，肝癌组织中CLEC9A表达水平[0.183(0.069~0.338)，0.187(0.076~0.405)]明显低于癌旁组织中CLEC9A表达水平[0.343(0.242~0.515)]，差异有统计学意义(P

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