高大的城堡中，大魔王库巴正享受着难得的清闲，顺便考虑着下一次的绑架公主计划。
　　“报——报告大王，那个毛脸大鼻子的水管工又打过来了！”一个传令的乌龟小兵跑进城堡大喊道。
　　“什么？我还没去绑架公主他怎么就打来了？这可如何是好？”库巴大惊道。“大王勿忧，老臣有一计可用。”老龟丞相，库巴新雇的参谋，立刻出起了主意，“近日老臣新悟出一套阵法——蘑菇阵，只要按此法排兵布阵，定能退敌！”“哦？这可真是太好了！”库巴大喜，立刻下令布阵迎敌。
　　库巴：“话说你这阵法不会又要用那些只会来回走的蘑菇小兵吧？它们在马里奥的‘铁蹄’下可是不堪一击啊。”
　　丞相：“大王不必担心，这次的蘑菇阵不需要那些笨蘑菇，我另请来了一些可靠的后援。”
　　第一关——会喷烟的炸弹菇
　　喷射烟雾？又不是烟雾弹，蘑菇怎么可能会喷烟呢？嘿嘿，这里的“烟雾”可不是烧火爆炸产生的烟雾，而是蘑菇的孢子！孢子是蘑菇的“种子”，通常只有几微米，需要在显微镜下才能看到。虽然一个孢子很小，但数亿个孢子看起来就像是一阵茫茫的烟雾了，而一个成熟的蘑菇可以轻松散发出数以亿计的孢子！特别是马勃属的蘑菇，它们会长成一个封闭的子实体（蘑菇产生孢子的器官），而不是像其他蘑菇那样的伞盖状子实体。当有人或动物踩到上面时，就会“砰”的一声，像炸弹爆炸般一下子炸出大量的孢子烟雾。
　　库巴：“咳咳……可以当烟雾弹来逼退马里奥，他的大鼻子肯定受不了这些孢子烟雾。”
　　丞相：“咳咳，没错，大量吸入孢子对身体可不太好。大王，我们还是去看下一关吧，咳咳。”
　　第二关——超级小喷菇
　　所谓“超级小喷菇”，其实并非我们通常所说的蘑菇，而是与蘑菇同在真菌大家族中的一类成员——水玉霉。这些小家伙可是能以32千米/时的速度将孢子喷射到2米以外的地方。什么，你认为32千米/时的速度也没多快？要知道这些水玉霉的个体非常小，空气对于它们来说简直就像是沼泽般黏稠，但它们仍能在2微秒（0.000002秒）内将孢子以高达2×104g（g为重力加速度）的加速度加速到32千米/时！这样的加速能力，别说是子弹，就连最先进的战斗机也望尘莫及！
　　库巴：“嗯……虽然挺厉害的，但这玩意也太小了吧，就算把马里奥缩小了也比它大啊。”
　　丞相：“嘿嘿，别忘了水玉霉是长在草食性动物的粪便上的，爱干净的人根本就不敢靠近。”
　　库巴：“你觉得能毫不犹豫地钻进下水管道的马里奥会怕它？”
　　丞相：“哦，忘了这茬，那我们接着看下一关。”
　　第三关——幻觉蘑菇
　　既然小喷菇不给力，那我们就来些猛料吧，看蘑菇阵的终极秘密武器——幻觉蘑菇！要说幻觉蘑菇的典型代表，当然非裸盖菇莫属了。裸盖菇体内含有大量裸盖菇素，这是一种神经毒素，能干扰神经系统的信号传递，使人产生幻觉。但与那些可怕的毒蘑菇不同，裸盖菇的致幻效果比较温和，一般不会致人死亡，只会使人又哭又笑、手舞足蹈，看到的东西会变得光怪陆离、旋转变化。居住在中美洲的土著人就将裸盖菇视为神物而用于祭祀和医疗。
　　库巴：“哇哦，这玩意简直就像是无敌小星星一样，吃了后有种五彩斑斓、闪个不停的感觉，连背景音乐都变了啊，噔噔、噔噔噔、噔……”
　　丞相：“我们可以把它伪装成无敌小星星来骗马里奥吃……哎，等等，大王，你可不能吃啊！”
　　数分钟后，马里奥来到城堡。
　　“库巴，我听说你这里有好多蘑菇，能不能借……咦？这是啥情况？”只是来借蘑菇的马里奥看到库巴领着一群乌龟载歌载舞。看来，蘑菇大作战成功了，只不过用在了库巴自己身上。