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在对一组具有相关关系的随机序列数据进行分类时,若序列很长,将这组数据看成是马尔可夫链的一个样本,于是,该问题就成为判别这组数据源于哪个马尔可夫信源总体的问题。在介绍马尔可夫信源熵及其极限熵的基础上,提出三个判别准则,并以DNA序列分类为例,分别进行验证,结果表明,判别准则3的性能优于其他方法。