砧木南瓜硅转运蛋白基因CmLsi3的克隆与表达分析

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以用于黄瓜嫁接的砧木南瓜‘云南黑籽南瓜’(Cucurbita ficifolia,去蜡粉能力弱)和‘黄诚根2号’(C.moschata,去蜡粉能力强)为试材,采用同源克隆与RACE相结合的方法克隆到硅转运蛋白基因c DNA全长,命名为CmL si3(Gen Bank登录号分别为KM203110和KM359142)。两种砧木南瓜Cm Lsi3基因c DNA全长为1 206 bp,开放阅读框为795 bp,编码264个氨基酸,两者仅有4个位点的氨基酸不同,但与黄瓜、玉米、大麦等作物硅转运蛋白氨基酸序列同源性均在50%以上。CmL si3蛋白含有2个NPA模体、6个跨膜结构域以及1个由Gly(G)、Ser(S)、Gly(G)和Arg(R)组成的ar/R选择性过滤器,属于水通道蛋白NIPⅢ亚家族。实时荧光定量分析表明,Cm Lsi3基因在砧木南瓜根、茎、叶中均有表达,且‘云南黑籽南瓜’各器官Cm Lsi3基因的表达水平高于‘黄诚根2号’。
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