目的:调查昌吉州(地、县)疾控中心现有人员情况,为优化配置疾控人才队伍提供参考依据。方法:对昌吉州及其所辖2市、5县的疾控中心人员现状进行问卷调查,作描述性分析,并用方差分析法将统计指标与新疆及全国平均水平作比较。结果:州(地级)疾控中心共有编制99个,在岗人员93人,空编6个;每万人口疾控人员拥有量为0.65,编制数为0.69;年龄分布46-55岁居多,占40%;学历以本科为主,占60.2%;职称以中级为主,占32.3%;民族以汉族为主,占72.0%;卫生技术人员占88.17%。县级疾控中心共有编制279个,在岗人员304人,超标率为9%,每万人口疾控人员拥有量为2.14,编制数为1.95;年龄分布35-46岁居多,占41.1%;学历以大专为主,占42.4%;职称以初级为主,占37.2%;民族以汉族为主,占68.8%;卫生技术人员占67.44%。昌吉州(地、县)疾控中心平均每万人口疾控人员拥有量低于全国平均水平,职称构成与全国存在差异。结论:昌吉州(地、县)疾控中心人员编制总量符合国家标准,但疾控人员配置不足与专业技术人员编制短缺并存;年龄分布不合理;学历及职称水平较低,未达到国家标准。应建立符合新疆地域特点的疾控卫生人力资源配置及编制指导原则;优化基层疾控人员组织构成,提升专业技术人员队伍素质;完善人才管理机制,稳定人才队伍。