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长白落叶松雌雄花，在水平枝上主要着生在第４，５，６年枝段上，在垂直方向上主要在第４年枝层以上下的各层上。落叶松球果，种子及种子萌发性状的树木个体间差异较大。某些性状的相关关系紧密，如大球果脱粒出的种大子，种子的发芽势，发芽率高，高出林冠层的老龄树木空粒种子多。高海拔地段地段的林木受局部地型的生态因子影响种子发芽率低。位于树冠上部的种子发芽势，发芽率最高，中部次之，下部最低，受花粉密度垂直梯度变化的