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基于分子拓扑理论，计算了从水香薷中分离出的19个挥发性成分的原子类型电性拓扑状态指数（Ek）和Kier分子价连接性指数（n^Xt^v）。使用最佳变量子集回归（LBR）建立了这些拓扑指数与水香薷中19种挥发性成分的气相色谱保留时间（RT）的最佳五元数学模型，其相关系数（R^2）为0．964，逐一剔除法（LOO）交叉验证系数（Q2）为0．924。该模型具有高度的稳健性与良好的预测能力，将其用于天然植物化学成分的分离、分析、结构表征及其食用价值的开发，具有理论指导意义。