【摘 要】
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南美蟛蜞菊(Wedelia trilobata)是华南地区危害严重的入侵植物,对其遗传多样性的研究仅局限于ISSR分子标记.本研究利用MISA软件对南美蟛蜞菊转录组测序获得的88 504条Unigene
【机 构】
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广州大学生命科学学院,广州,510006
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南美蟛蜞菊(Wedelia trilobata)是华南地区危害严重的入侵植物,对其遗传多样性的研究仅局限于ISSR分子标记.本研究利用MISA软件对南美蟛蜞菊转录组测序获得的88 504条Unigene进行了 SSR位点及特征分析,结果发现SSR位点23 338个,SSR出现频率为26.37％,发生频率为21.07％,平均距离为1 224.61 kb.其中单核苷酸重复所占比例最高,占总SSR位点的46.92％.二核苷酸重复类型和三核苷酸重复类型分别占26.66％和24.55％.本研究对南美蟛蜞菊转录组测序得到的23 338个SSR位点使用Primer 3软件进行引物设计,随机选择了 200对引物进行了扩增实验验证,有效扩增55对,其中6对引物特异性高,重复性好.平均Shannon's多样性信息指数(I)和多态性信息含量(PIC)分别为0.760和0.511,表明其具有较高的多态性.本研究结果为今后开展南美蟛蜞菊遗传多样性方面的研究提供了实验基础.
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