【摘 要】
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摘要：【目的】通過高通量测序技术调研卵形鲳鲹基因组数据并开发SSR分子标记，为卵形鲳鲹全基因组测序与组装、种质资源保护利用及良种选育提供技术支撑。【方法】通过Illumina Hiseq 2500测序平台对卵形鲳鲹基因组进行调研，采用K-mer方法对基因组大小、杂合率、G+C含量及序列重复性等进行分析，从调研数据中分析SSR的分布特征，筛选出多态性SSR位点，并对卵形鲳鲹养殖群体进行遗传多样性分析
【机 构】
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广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室
【基金项目】
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广西创新驱动发展专项(桂科AA17204080-3,桂科AA18242031-2),广西公益性科研院所基本科研业务费专项(CXIF-2016-03)
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[目的]通过高通量测序技术调研卵形鲳鲹基因组数据并开发SSR分子标记,为卵形鲳鲹全基因组测序与组装、种质资源保护利用及良种选育提供技术支撑。[方法]通过Illumina Hiseq 2500测序平台对卵形鲳鲹基因组进行调研,采用K-mer方法对基因组大小、杂合率、G+C含量及序列重复性等进行分析,从调研数据中分析SSR的分布特征,筛选出多态性SSR位点,并对卵形鲳鲹养殖群体进行遗传多样性分析。[结果]卵形鲳鲹基因组大小为642.68 Mb,杂合率为0.31%,重复序列比例为30.19%,G+C含量为41.
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