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肠道微生物主要包括细菌、古生菌、真菌和病毒等，它们在肠道中寄居形成相对稳定的群落，并与宿主相互作用、相互影响，形成具有互利共生关系的统一体，即为肠道微生态。肠道微生物群落常被视为人体的“第二大脑”或“第二基因组”，参与人体的营养吸收、能量代谢、组织器官发育、免疫防御及内分泌调控等多种重要的生理学过程，与人体健康密切相关。