【摘 要】
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生物钟节律基因(circadian clock gene)CCA1在植物光周期途径中具有十分重要的作用.以高羊茅\'黔草1号 cDNA为模板,利用同源扩增结合cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术从高羊茅中获得与拟南芥CCA1高度同源的cDNA全长序列,命名为FaCCA1.利用BLAST在线软件对该基因进行生物信息学分析,通过农杆菌介导的烟草瞬时表达,观察FaCCA1基因编码蛋白的亚细胞定位,并利用RT-qPCR技术分析不同光照条件下Fa
【机 构】
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贵州省农业科学院/贵州省草业研究所,贵阳550006;贵州大学生命科学学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/喀斯特山区植物资源利用与育种国家地方联合工程研究中心,贵阳550025;贵州省农
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生物钟节律基因(circadian clock gene)CCA1在植物光周期途径中具有十分重要的作用.以高羊茅\'黔草1号 cDNA为模板,利用同源扩增结合cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术从高羊茅中获得与拟南芥CCA1高度同源的cDNA全长序列,命名为FaCCA1.利用BLAST在线软件对该基因进行生物信息学分析,通过农杆菌介导的烟草瞬时表达,观察FaCCA1基因编码蛋白的亚细胞定位,并利用RT-qPCR技术分析不同光照条件下FaCCA1基因表达水平.结果表明,该序列cDNA全长为2 433 bp,含有一个完整的开放阅读框,长度为2 148 bp,编码蛋白含有715个氨基酸,蛋白分子量为77.80 kDa,理论等电点为5.91.亚细胞定位结果显示FaCCA1基因所编码的蛋白定位于细胞核.系统进化树分析表明FaCCA1与禾本科植物的CCA1蛋白亲缘关系较近,其中与大麦亲缘关系最近,达到80％以上.FaCCA1基因表达量在长日照高于短日照,表达水平出现昼夜节律钟变化模式,表明高羊茅FaCC41表达量受光周期调控.这为高羊茅FaCCA1基因的功能研究提供参考资料,为高羊茅的分子育种利用提供了改良靶标.
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MYB是一类重要的转录因子,广泛参与植物生长发育、次生代谢调控和非生物胁迫响应等生物学过程.本研究从茶树中成功克隆了一条CsMYB-like转录因子,CDS序列全长为1 113 bp,编码370个氨基酸.生物信息学分析表明其与蓝果树(Nyssa sinensis)、葡萄(Vitis vinifera)等MYB-like氨基酸序列有较高的相似性.亚细胞定位分析表明CsMYB-like基因编码的蛋白主要定位于细胞核.实时荧光定量PCR结果表明,CsMYB-like基因在不同的茶树品种中表达量不同,并且在不同浓
UDP-糖基转移酶在植物中通常以基因家族的形式存在,在进行植物糖基化研究时,常常难以克隆到所需的目的基因.本研究对甜橙子房、花后20d及40 d幼果进行转录组测序,筛选出了 36个高表达CsUGT基因.36个CsUGT基因的编码蛋白在motif组成上高度相似,其中,36个CsUGT的C端普遍含有motif 1和motif 2,24个CsUGT的N端含有motif 3.它们的氨基酸数介于345～780 aa之间,分子量介于38.52～87.55 kDa之间,等电点介于4.76～7.93之间.亚细胞定位预测显
文冠果(Xanthoceras sorbifolium)是具有广阔发展前景的木本能源树种,目前产业发展的主要限制因素即雌雄比例低,产量不理想.解决雄能花的雌蕊败育问题可以有效提高其产量.本研究综述了近年来文冠果雌蕊败育的研究进展,包括雌蕊败育的发生时期与形态特征以及雌蕊败育的原因、克服办法,并展望了针对文冠果雌蕊败育机理的研究方向.
体胚发生是指植物组织在外源刺激的推动下,由体细胞经历脱分化,获得胚性后继续增殖分化,最终形成完整胚胎的过程.体胚发生是植物离体再生的一种重要途径,在植物无性快繁、遗传转化等领域都具有巨大的应用价值.本文将体胚发生过程分为诱导、增殖、体胚发育三个相对独立的阶段,对体胚发生过程中特别是诱导阶段的分子调控机制进行了分析总结.在诱导阶段,体细胞经历脱分化过程重新获得全能性,通过LEC1、LEC2、WOXs、BBM等胚性标记基因的表达转变为胚性细胞.随后,胚性细胞在高浓度外源生长素的条件下保持增殖,当去除外源激素后
自噬是存在于真核生物体内的一种进化高度保守的细胞代谢途径.从酵母细胞到哺乳动物都依赖自噬来降解体内受损器官、组织等进行养分循环以维持细胞稳态以及适应环境变化.近年来,自噬在调控果蔬作物胁迫响应及衰老中的作用受到了人们广泛的关注.本文阐述了自噬(主要是巨自噬)的形成及检测方法,概括总结了自噬在果蔬作物响应外界环境胁迫及衰老中的作用及自噬的调控因子,以期为自噬调控果蔬作物胁迫响应及衰老的研究提供参考.
小麦耐热性是多基因控制的复杂数量性状,通过关联耐热性状获得耐热分子标记,利用该标记辅助选择育种可提高育种的准确性,加快小麦耐热育种进程.本研究对187份小麦品种(系)的千粒重、籽粒长度、籽粒宽度、籽粒表面积和籽粒周长5个籽粒相关性状的热感指数进行关联分析,鉴定出2个耐热相关分子标记Xwmc622、Xwmc707.聚丙烯酰胺凝胶电泳分析表明,Xwmc622、Xwmc707各自具有Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3个等位变异类型.Xwmc622的Ⅰ型等位位点与千粒重热感指数、籽粒宽度热感指数和籽粒周长热感指数呈极显著负相关关系,同
SPX保守结构域(SPX domain)在植物营养胁迫中发挥着重要作用.SPX2为SPX家族中的SPX亚家族成员,已证明其在拟南芥、水稻中具有调控植物磷信号的功能.通过马尾松幼苗三代全长转录组数据和染色体步移法,克隆PmSPX2基因的全长序列及该基因的启动子序列;分析预测启动子序列上的顺式作用元件;利用IPTG诱导大肠杆菌表达PmSPX2蛋白,将原核表达产物进行质谱鉴定;分析PmSPX2的亚细胞定位;检测PmSPX2在低磷胁迫不同时期马尾松幼苗各组织部位的表达情况.结果 表明:PmSPX2 cDNA全长2
With the decreasing cost and availability of many newly developed bioinformatics pipelines,next-generation sequencing (NGS) has revolutionized plant systematics in recent years.Genome skimming has been widely used to obtain high-copy fractions of the geno
本研究通过解析水稻芽期耐淹性的遗传基础,挖掘相关QTL,筛选优良单株,为分子标记辅助育种提供优异种质和理论支撑.选取318份国内外水稻种质资源,在正常有氧和厌氧条件下测定种子萌发期的胚芽鞘长度,并计算相对胚芽鞘长度,通过整合基因型和表型数据进行全基因组关联分析.318份水稻种质间相对胚芽鞘长度差异明显,相对胚芽鞘长度的平均值为-0.238,中位值为-0.342,最低值为-0.923,最高值为3.069.全基因组关联分析共鉴定到83个SNP与种子耐厌氧萌发性状显著相关.通过合并距离较近的SNP,共鉴定到27
GmILPA1是控制大豆叶柄夹角的重要基因,其主要通过促进细胞的生长和分裂来影响叶枕形成,该基因突变后可使叶枕发育异常、叶柄夹角增大.然而,该基因在大豆种质资源的多态性变异与叶柄夹角的关系未见报道.本研究利用783份大豆种质资源的重测序数据,对该基因进行单倍型分析,挖掘GmILPA1基因序列的自然变异,分析与叶柄夹角的关系.结果 表明,在783份种质资源中共检测到32个多态性位点,包括13个SNPs和19个Indel,频率分别为1Sw285 bp和1Indel/195 bp,共组成9种单倍型,其中Hap1