口蹄疫病毒株AF72 VP1的结构构建与B细胞表位预测

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以口蹄疫病毒株AF72 RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEM-T easy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和EcoR I酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序.比对测序结果确定AF72 VP1的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72 VP1结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72 VP1结构蛋白的B细胞抗原表位.结果显示,VP1结构蛋白呈现较规则的空间构象,其中5~11、24~30、43~47、82~87、132~147和196~203氨基酸区段是AF72 VP1结构蛋白可能的B细胞抗原表位区域,该结果将为进一步的FMDV多表位疫苗研究提供很有价值的参考信息.
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