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给出了二重比对SPA算法的一个扩展，把SPA算法推广到蛋白质编码基因的比对中．首先利用经典的密码子进化模型，得到了密码子两两的得分矩阵，并用该矩阵对SPA算法进行了修改，使其更加合理有效地应用于蛋白质编码基因的比对．
基于SPA的蛋白质编码基因的比对
【摘 要】
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给出了二重比对SPA算法的一个扩展，把SPA算法推广到蛋白质编码基因的比对中．首先利用经典的密码子进化模型，得到了密码子两两的得分矩阵，并用该矩阵对SPA算法进行了修改，使其更加
【机 构】
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南开大学数学科学学院
【出 处】
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南开大学学报：自然科学版
【发表日期】
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2008年2期
【基金项目】
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国家自然科学基金（10271061,90208022）,天津市应用基础研究计划项目（07JCZDJC06400）
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