并行矩阵乘的光化学反应模拟研究

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在Linux环境下,为缩短激光诱导光化学反应模拟运行时间,针对光化学反应模拟中力矩阵的稀疏特征,将力矩阵进行分块划分,采用优化的行列分解算法对分块矩阵进行并行化,运用OpenMP实现光化学反应力计算并行化。实验结果表明,在500个C原子参与运算的情况下,单步计算时间缩短到优化前计算时间的10-2数量级,在十六核处理器上获得了十四倍的加速比和80%以上的效率,为高效模拟大分子体系光化学反应提供平台。
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