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白念珠菌形成生物膜后耐药性明显增加，几乎对所有抗真菌药物（除了棘球白素和两性霉素B脂质体）具有高度耐药性。白念珠菌生物膜的耐药机制尚未完全清楚，可能与细胞外基质物理屏障作用、细胞营养受限生长代谢缓慢、耐药基因的表达、麦角甾醇的异常、耐药株的存在、附着面粗糙度、微环境的改变以及对抗机体的免疫防御等因素有关，它可能是一种多因素、多机制共同作用的结果。