【摘 要】
:
目的探索沉默APE-1对肝癌细胞Hep 3B转录组表达谱及TNF信号通路的影响。方法基于沉默APE-1表达的肝癌Hep 3B稳定细胞株,进行转录组测序。实验组为APE-1沉默表达的细胞,对照组为转染空白质粒的细胞(n=3)。生物信息学分析肝癌细胞差异表达基因变化及差异基因的GO、KEGG、DO功能富集,蛋白互作网络。针对TNF信号通路关键基因TNFAIP3、MAP2K6,RT-PCR检测其在实验/对照组细胞中表达,收集10对肝癌/癌旁临床样本,免疫组化检测其蛋白表达。基于TCGA数据库中374例肝癌患者数
【机 构】
:
首都医科大学附属北京世纪坛医院胃肠肝胆肿瘤外科
【基金项目】
:
中国铁路总公司科技研究开发课题(编号:J2017Z609),首都医科大学附属北京世纪坛医院医院课题基金(编号:2019-C10),首都医科大学肿瘤治疗性疫苗北京市重点实验室开放课题(编号:2019-KF02),北京市教委科技计划一般项目(编号:KM202010025008)。
论文部分内容阅读
目的探索沉默APE-1对肝癌细胞Hep 3B转录组表达谱及TNF信号通路的影响。方法基于沉默APE-1表达的肝癌Hep 3B稳定细胞株,进行转录组测序。实验组为APE-1沉默表达的细胞,对照组为转染空白质粒的细胞(n=3)。生物信息学分析肝癌细胞差异表达基因变化及差异基因的GO、KEGG、DO功能富集,蛋白互作网络。针对TNF信号通路关键基因TNFAIP3、MAP2K6,RT-PCR检测其在实验/对照组细胞中表达,收集10对肝癌/癌旁临床样本,免疫组化检测其蛋白表达。基于TCGA数据库中374例肝癌患者数
其他文献
随着经济的快速发展,酸雨已成为危害人类健康的生态环境问题之一.作为最大的发展中国家,中国的工业化和城市化进程加快,酸雨引起的环境问题日益受到各界人士的广泛关注.为了
目的探讨在兔伸直型膝关节挛缩模型中肌源性挛缩的病理特征及其可能机制。方法选取新西兰白兔30只,根据固定时间,随机分为以下5组(n=6):对照组(I-0,不进行任何处理)、固定1周组(I-1,左膝关节伸直位固定1周)、固定2周组(I-2,左膝关节伸直位固定2周)、固定4周组(I-4,左膝关节伸直位固定4周)和固定8周组(I-8,左膝关节伸直位固定8周)。然后通过检测固定后膝关节挛缩角度、股直肌Masson染色、低氧诱导因子(HIF)-1α和转化生长因子(TGF)-β1的蛋白表达水平,分析各组结果差异。结果在
目的分析JTE-907(大麻素类CB2受体反向激动剂)对中性粒细胞大鼠哮喘模型的治疗效果,并通过观察其对CD4+幼稚T细胞分化影响来确定CB2受体活化的潜在治疗机制。方法采用大鼠脾脏分离的T淋巴细胞Th系特异性分化系统分析JTE907对T细胞亚型分化的影响。通过qRT-PCR检测Tbx21、Gata3、白介素(IL)-9、维甲酸受体相关孤儿受体(ROR)-C、FoxP3、CNR2 mRNA表达。将40只动物随机分为4组(n=10):正常对照组、模型组、JTE-907低剂量组(JTE-907-L,腹腔注射5
目的探讨沉默人附睾蛋白4(HE4)对结肠癌细胞增殖、侵袭、凋亡和JAK/STAT3信号通路的影响。方法选取124例结肠癌患者和40例健康人。用Western blot和免疫组织化学染色法检测结肠癌组织和癌旁组织中HE4的表达水平。酶联免疫吸附试验(ELISA)检测结肠癌患者和健康人血清中HE4的表达水平。Western blot检测结肠癌细胞株Caco-2、SW480、HT-29、HCT-116和正常结肠上皮细胞株HCoePic中HE4的表达水平。用HE4 si-RNA或si-control分别转染HT-
目的基于网络药理学方法探讨姜黄-白芍药对治疗类风湿关节炎(RA)的协同机制。方法通过TCMSP平台和文献资料筛选姜黄-白芍药活性成分及对应的靶点蛋白,应用Cytoscape 3.7.1软件构建药物-成分-靶点网络。在GeneCards、OMIM、CTD数据库中检索“Rheumatoid Arthritis”,获取RA疾病靶点。对药对和RA共同靶点进行PPI网络分析,GO富集和KEGG通路富集分析。结果获取药对13种活性成分及445个潜在靶点,RA疾病2060个相关靶点,得到姜黄、白芍、RA三者共同靶点53
目的观察miR-513a-3p在结肠癌组织与癌旁正常组织的表达差异,探讨miR-513a-3p诱导结肠癌(CRC)细胞生长和迁移的机制。方法收集CRC患者30例作为研究对象,原位杂交和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分别检测CRC组织与癌旁组织miR-513a-3p的表达水平。取人CRC细胞株HT-29和SW480培养后,转染miR-513a-3p类似物作为促进表达组,设置阴性对照组,四甲基偶氮唑盐(MTT)比色法实验两组细胞活力,Transwell法检测细胞侵袭情况,细胞划痕实验检验细胞迁移能力,W
目的探讨沙格列汀通过miR-15a-5p/胰岛素受体(INSR)轴缓解2型糖尿病大鼠胰岛素抵抗的机制。方法以INSR为常用转录本ENST00000341500为输入,分别获取TargetScan、miRDB和miRWalk数据库中可能靶向INSR的miRNA并取交集。随后荧光素酶实验验证靶向关系。构建胰岛素抵抗2型糖尿病(IR-T2DM)模型。随后对IR-T2DM大鼠进行阴性对照、miR-15a-5p mimic、miR-15a-5p inhibitor转染或沙格列汀处理,8周后处死大鼠获取股四头肌及外周
目的探讨CD98基因沉默对黑色素瘤B16-F10细胞增殖、凋亡及PI3K/AKT通路的影响。方法构建shRNA CD98载体转染至B16-F10细胞,将细胞随机分为3组:Control组、shRNA-NC组、CD98-shRNA3组进行后续实验。克隆形成实验检测细胞增殖;流式细胞仪检测细胞凋亡;Transwell检测细胞侵袭;Western blot检测CD98、Ki67、PCNA、Bax、Bcl-2、Caspase-3、PI3K、p-PI3K、AKT、p-AKT蛋白表达水平。结果与Control组比较,
目的探讨肝癌(HCC)患者体内可溶性甘露糖受体(sMR)的表达水平及其临床意义。方法采用酶联免疫吸附实验检测肝癌、慢性乙型肝炎(CHB)患者及健康对照(HC)者血清sMR水平,统计一般资料,比较不同分期及病理特征患者血清sMR水平,并通过绘制ROC曲线评价sMR及AFP对肝癌的诊断效能。结果肝癌患者血清sMR水平高于慢性乙型肝炎及健康对照者,并且与肿瘤分期、大小及数目有关,血清sMR与AFP联合检测对于肝癌的诊断水平高于AFP。结论血清sMR水平在肝癌患者中升高,sMR对肝癌诊断具有重要临床意义和应用价值
目的探究亚硒酸钠对肺癌细胞生物学行为的影响以及如何通过NF-κB信号通路影响肺癌凋亡的具体机制。方法CCK-8细胞增殖实验、细胞划痕实验观察肺癌细胞的增殖和迁移的能力;流式细胞术、qPCR和Western blot实验检测不同浓度亚硒酸钠处理后的肺癌细胞的凋亡率、凋亡标志因子Bcl-2和Bax的mRNA和NF-κB信号通路相关蛋白(NF-κB、p-NF-κB、IkBα、p-IkBα)的变化水平;细胞免疫荧光实验观察p-NF-κB在细胞内的变化水平和分布情况。结果CCK-8细胞增殖实验和细胞划痕实验显示肺癌