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针对带扰动不确定分数阶混沌系统的同步问题，基于自适应Terminal滑模控制，设计了一种分数阶非奇异Tererminal滑模面，保证误差系统沿着滑模面在有限时间内稳定至平衡点，在系统外部扰动和不确定性的边界事先未知的情况，设计了自适应控制率，在线估计未知边界，使得同步误差轨迹能到达滑模面。最后，以三维分数阶Chen系统和四维分数阶Lorenz超混沌系统为例，利用所设计的自适应Terminal滑模控制器进行同步仿真，验证了所给方法是有效性和可行性。