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在论述克隆聚类的基本概念及其特点的基础上,探讨了基于克隆聚类的农产品加工企业IDS的优势。根据农产品加工企业的实际需求,重点介绍了无监督的克隆聚类算法,设计并实现了基于克隆聚类算法的入侵检测系统,最后使用KDD CUP 99数据集进行了计算机仿真实验,结果表明能够显著提高检测率和降低误报率。