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SSR标记技术已成为检测植物遗传差异的一项可靠技术.本研究利用选取的33对南瓜SSR引物,对2个中国南瓜杂交品种(大果蜜本与蜜宝)和2个杂交组合(P12与P13)的杂交种样品进行了纯度鉴定,并与田间形态鉴定结果进行了对比分析,研究表明SSR鉴定与田间种植鉴定的结果差异在0.7～1.8％之间，相关系数达到0.999,达到极显著相关水平,并进一步建立回归方程。本研究结果证明了SSR标记技术应用于南瓜杂交种纯度鉴定工作的可行性与可靠性。