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草鱼出血病病毒基因组由11条dsRNA片段组成。最近在研究基因组时发现，在病毒基因组外存在的许多核酸成份，但在核苷酸数量上少于基因组成份，表现为较小分子量的RNA片段。在完整地克隆了这些片段的全长cDNA后，测定了其中两个克隆的序列组成，发现它们为病毒基因组经剪切后的部分片段，已经重新装配，而且都含有原基因组某一片段3′端和5′的保守区和倒转重复区，缺失中间部分。根据其特点来看，它们应为目前病毒学研究的重要材料－缺损性干扰颗粒的亚基因组成份。