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国家小麦工程技术研究中心是1996年经国家科技部批准，依托河南农业大学组建的从事小麦科研和工程化开发的科研单位，2000年通过科技部验收并正式命名。下设有科研部，开发部和办公室等机构。科研部设有生理生态、生育调控与生物技术、遗传育种等研究室以及小麦品质分析实验室。开发部下设有“河南国家小麦工程技术开发有限公司”、“优质小麦加工实验基地”、“农业智能化研究所”等企业。