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南水北调西线第一期工程位于青藏高原东部边缘地带。项目区人口稀少，人为开发扰动程度较轻，属高寒脆弱生态系统。南水北调西线一期工程实施后对该区生态系统完整性和生态敏感区域产生的影响包括：对生物群落的完整性影响；对湿地、自然保护区及干旱河谷等生态敏感区的影响。主要结论是：工程建设对项目区区域生态完整性产生一定影响，需要相应的生态恢复措施做保障；对湿地和自然保护区的影响不会导致植物种类之间的演替变化和某些珍稀植物种类的灭绝；不会导致干旱河谷区区域气候发生明显改变。