【摘 要】
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目的 探究自拟方马归液干预膀胱癌的分子生物学机制。方法 使用TCMSP及BATMAN-TCM数据库获得马归液组成的有效成分和作用靶点;使用GEO数据库获得肿瘤及正常样品数据集,运用RobustRankAggreg法多芯片联合分析膀胱癌差异表达基因;Cytoscape软件构建药物-成分-交集靶点网络图;对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;分子对接
【基金项目】
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湖南省科技创新计划项目(2018SK51206); 湖南省卫生健康委一般指导项目(202204054156);
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目的 探究自拟方马归液干预膀胱癌的分子生物学机制。方法 使用TCMSP及BATMAN-TCM数据库获得马归液组成的有效成分和作用靶点;使用GEO数据库获得肿瘤及正常样品数据集,运用RobustRankAggreg法多芯片联合分析膀胱癌差异表达基因;Cytoscape软件构建药物-成分-交集靶点网络图;对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;分子对接技术验证靶点与成分之间结合的可靠性;GEPIA数据库验证靶点的表达情况。结果 获得马归液有效成分38种,差异基因770个,药物与疾病交集靶点26个,槲皮素、山奈酚等药物关键成分,E2F2、CCNB1和TOP2A等关键靶点;主要涉及的生物学过程有细胞再生、金属离子反应和细胞通讯等;关联细胞衰老、细胞周期、脂质代谢等信号通路。结论 马归液通过靶向E2F2、CCNB1、JUN、TOP2A和MMP1等靶点,经由多个生物学过程及多条通路协同作用,发挥干预膀胱癌的作用。
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