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对我国四个地区牡丹主要栽培品种rDNAITS区序列进行测定，研究各居群rDNAITS序列特征及差异，建立不同地区主要牡丹栽培品种的区域性分子标记，参照GeneBank信息（登录号：U27692）利用Clustal X、MEGA3．1分子进化遗传分析软件对测序结果排序。牡丹ITS全序列长度为652bp，相对于GenBank中牡丹rDNAITS全序列在448位少一个C碱基，其中ITS1为267bp，5．8s为163bp，ITS2为222bp，GC含量为55．7％-56．9％，共有30个变异位点，主要发生在IT